წარმოიდგინეთ გენეტიკურ ტესტზე დადებითი შედეგის მიღება. ექიმი გეუბნებათ, რომ თქვენ გაქვთ „პათოგენური გენეტიკური ვარიანტი“ან დნმ-ის თანმიმდევრობა, რომელიც, როგორც ცნობილია, ზრდის ისეთი დაავადების მიღების შანსებს, როგორიცაა ძუძუს კიბო ან დიაბეტი. მაგრამ რა არის ეს შანსები - 10 პროცენტი? Ორმოცდაათი პროცენტი? Ასი? ამჟამად, ამ კითხვაზე პასუხის გაცემა ადვილი არ არის.
ამ საჭიროების გადასაჭრელად, სინას მთაზე აიკანის მედიცინის სკოლის მკვლევარებმა გაანალიზეს დნმ-ის თანმიმდევრობა და ათასობით ადამიანის ჯანმრთელობის ელექტრონული ჩანაწერი, რომლებიც ინახება ორ მასიურ ბიობანკში.საერთო ჯამში, მათ აღმოაჩინეს, რომ პათოგენურმა გენეტიკურმა ვარიანტმა შეიძლება გამოიწვიოს დაავადება, შედარებით დაბალია - დაახლოებით 7 პროცენტი. მიუხედავად ამისა, მათ ასევე დაადგინეს, რომ ზოგიერთი ვარიანტი, როგორიცაა ძუძუს კიბოსთან დაკავშირებული, დაკავშირებულია დაავადების რისკების ფართო სპექტრთან. JAMA-ში გამოქვეყნებულმა შედეგებმა შეიძლება შეცვალოს ამ ვარიანტებთან დაკავშირებული რისკების მოხსენება და ერთ მშვენიერ დღეს დაეხმაროს ექიმების გენეტიკური ტესტირების შედეგების ინტერპრეტაციას.
"ამ კვლევის მთავარი მიზანი იყო გამოსადეგი, მოწინავე სტატისტიკის გამომუშავება, რომელიც რაოდენობრივად აფასებს დაავადების გამომწვევ ცნობილ გენეტიკურ ვარიანტებს ინდივიდის დაავადების რისკზე გავლენას", - თქვა რონ დომ, დოქტორმა, ასოცირებულმა პროფესორმა. გენეტიკა და გენომიკური მეცნიერებები და ჩარლზ ბრონფმანის პერსონალიზებული მედიცინის ინსტიტუტის წევრი აიკანის მთაზე.
ბოლო 20 წლის განმავლობაში მეცნიერებმა აღმოაჩინეს ასობით ათასი ვარიანტი, რომელსაც შეუძლია სხვადასხვა დაავადების გამოწვევა.თუმცა, ამ აღმოჩენების ბუნების გამო, რთული იყო თითოეული გენის ვარიანტისთვის ამის დადგენა ან სტატისტიკის მიწოდება. ჯერჯერობით, შეფასებების უმეტესობა ეყრდნობა კვლევებს, რომელშიც ჩართული იყო სუბიექტების მცირე რაოდენობა, რომლებიც ან იმ ოჯახის წევრები იყვნენ, რომლებსაც ჰქონდათ დაავადების ისტორია, ან იყვნენ რეკრუტირებული დაავადების სპეციფიკურ კლინიკებში. მაგრამ მსგავსი კვლევები, რომლებიც არ იყენებენ შემთხვევით არჩეულ დიდ პოპულაციებს, შესაძლოა წარმოქმნან ვარიანტების რისკის გადაჭარბებული შეფასება.
ამ კვლევაში, მკვლევარებმა გადაწყვიტეს ეს საკითხი 72,434 ინდივიდის დნმ-ის სკვევენირების ფართომასშტაბიანი მონაცემების მოძიებით 37,780 ცნობილი ვარიანტისთვის და შემდეგ თითოეული ინდივიდის ჯანმრთელობის ჩანაწერების სკანირებით დაავადების შესაბამისი დიაგნოზისთვის. ფართო ძიებაში ჩართული იყო 29,039 მონაწილე Mount Sinai's Bio Me ® Biobank პროგრამაში და 43,395 მონაწილე, რომლებიც იყვნენ გაერთიანებული სამეფოს ბიობბანკის ნაწილი.
კვლევას ხელმძღვანელობდა იაინ ს. ფორესტი, დოქტორის დოქტორის კანდიდატი დოქტორ დოს ლაბორატორიაში, რომელმაც შთაგონება მიიღო წინა კლინიკური გამოცდილებიდან, რომელიც მას ჰქონდა, როგორც პოსტბაკალავრიატის სტიპენდიის ნაწილი ჯანმრთელობის ეროვნულ ინსტიტუტში (NIH).
"შესწავლის იდეა წარმოიშვა ტვინის შტორმის სესიის შედეგად," თქვა მისტერ ფორესტმა. "მე და დოქტორ დომ განვიხილეთ დაავადების რისკის კლასიფიკაციის უკეთესი სისტემის არსებობის აუცილებლობა. ამჟამად, ვარიანტები კატეგორიზებულია ფართო ეტიკეტებით, როგორიცაა "პათოგენური" ან "კეთილთვისებიანი". როგორც კლინიკაში გავიგე, ამ ეტიკეტებზე ბევრი ნაცრისფერი ადგილია. სწორედ მაშინ მივხვდით, რომ ბიობბანკები, რომლებიც დნმ-ის თანმიმდევრობის მონაცემებს აკავშირებენ ჯანმრთელობის ელექტრონულ ჩანაწერებთან, შეუდარებელი შესაძლებლობაა ამ საჭიროების დასაკმაყოფილებლად.“
პირველმა შედეგებმა აჩვენა, რომ 157 დაავადება მათ მონაცემთა ნაკრებში შეიძლება იყოს დაკავშირებული 5,360 ვარიანტთან, რომლებიც განისაზღვრა როგორც "პათოგენური" ClinVar-ის მიერ, ფართოდ მოხსენიებული, NIH-ის მიერ მხარდაჭერილი საჯარო ბიბლიოთეკა, ან "დაკარგვის" ფუნქცია“, როგორც ნაწინასწარმეტყველებია ბიოინფორმაციული ალგორითმები. საშუალოდ, "შეღწევადობა" ან შანსი იმისა, რომ ვარიანტი დაკავშირებულია დაავადების დიაგნოზთან, დაბალი იყო, კონკრეტულად 6,9 პროცენტი. ანალოგიურად, საშუალო რისკის სხვაობა, რომელიც აღწერს დაავადების რისკის ზრდას ინდივიდისთვის, რომელსაც აქვს ეს ვარიანტი, ასევე დაბალი იყო.
"თავიდან საკმაოდ გაკვირვებული ვიყავი შედეგებით. რისკები, რომლებიც აღმოვაჩინეთ, იმაზე დაბალი იყო, ვიდრე ველოდი", - თქვა დოქტორმა დომ. "ეს შედეგები ბადებს კითხვებს იმის შესახებ, თუ როგორ უნდა დავახარისხოთ ამ ვარიანტების რისკები."
ამ შედეგების მიუხედავად, ზოგიერთ გენეტიკურ ვარიანტთან დაკავშირებული რისკები მაღალი რჩებოდა. მაგალითად, სარძევე ჯირკვლის კიბოს გენების BRCA1 და BRCA2 პათოგენურ ვარიანტებს აქვთ საშუალოდ 38 პროცენტიანი შეღწევადობა, ცალკეული ვარიანტები მცირდება ნულიდან 100 პროცენტამდე.
შემდეგმა შედეგებმა აჩვენა ბიობანკის მონაცემების გამოყენების სხვა უპირატესობები. ერთ მაგალითში, მკვლევარებმა შეძლეს გამოთვალონ ცალკეული ვარიანტების რისკები, რომლებიც დაკავშირებულია ასაკთან დაკავშირებულ დარღვევებთან, როგორიცაა ტიპი 2 დიაბეტის ზოგიერთი ფორმა და სარძევე ჯირკვლისა და პროსტატის კიბო. საშუალოდ, ამ ვარიანტების შეღწევადობა იყო დაახლოებით 10 პროცენტი 70 წელზე უფროსი ასაკის პირებისთვის, ხოლო დაახლოებით 8 პროცენტი იყო 20 წელზე უფროსი ასაკის ადამიანებისთვის.
გუნდმა ასევე დაადგინა, რომ ზოგიერთი ვარიანტის არსებობა შეიძლება დამოკიდებული იყოს ინდივიდის ეთნიკურ კუთვნილებაზე და დაადგინა 100-ზე მეტი ვარიანტი, რომლებიც კონკრეტულად გვხვდება არაევროპული წარმოშობის ინდივიდებში.
და ბოლოს, ავტორებმა ჩამოთვალეს რამდენიმე პოტენციური გზა, რომლებზეც თავად კვლევას შეეძლო მოხსენებული რისკების ნაკლებობა ან გადაჭარბებული შეფასება.
"მიუხედავად იმისა, რომ მეტი კვლევაა საჭირო, ჩვენ ვგრძნობთ, რომ ეს კვლევა არის კარგი პირველი ნაბიჯი იმისთვის, რომ საბოლოოდ მივაწოდოთ ექიმები და პაციენტები ზუსტი და ნიუანსირებული ინფორმაციისთვის, რომელიც მათ სჭირდებათ უფრო ზუსტი დიაგნოზის დასადგენად", - თქვა დოქტორმა დო.
